[Iván Fuentes]

Como moderador y técnico te diría que conviene separar claramente tres niveles.

Una plantilla madre intocable.
Plantillas derivadas por tipo de proyecto.
Y ajustes puntuales solo en copias, nunca sobre la base.

Hay estudios que incluso documentan esto como procedimiento interno, algo similar a lo que se comenta en https://www.plataformaarquitectura.cl/cl/guia-documentacion-proyectos aunque adaptado a cada caso.